Серьезного внимания заслуживает охрана лилий в нашей стране в природных местообитаниях. Особенно тревожно положение с л. Ледебура — вида, обладающего исключительно высокими декоративными качествами и имеющего крайне ограниченный ареал, с л. мозолистой, л. поникающей, л. ложнотигровой, также произрастающими в нашей стране на очень ограниченной территории, с уникальными желтоцветковыми лилиями Кавказа, которые подвергаются ежегодному неумеренному сбору на букеты, а кроме того, большое количество луковиц выкапывается. Сокращаются ареалы и других видов лилий. Проблема защиты этих растений в настоящее время стоит особенно остро. В Красную книгу СCCP (1984)—официальный справочник о состоянии нуждающихся в охране видов флоры СCCP—включены 6 видов лилий: л. мозолистая, л. поникающая, л. кавказская (л. кудреватая подвид кавказский), л. Ледебура, л. ложнотигровая, л. Кессельринга. В книге приведены данные о состоянии и мерах охраны редких и находящихся под угрозой исчезновения видов дикорастущих растений и о необходимых мероприятиях по их сохранению и рациональному использованию. В нашей стране подобные мероприятия наиболее эффективны, поскольку на страже охраны природы стоит государство. Так, во многих республиках и краях ряд видов растений местной флоры взят под охрану специальными постановлениями органов власти. Конкретные меры должны разрабатываться на местах с учетом сложившихся условий.

Охрана растений невозможна без сохранения условий их обитания. На территории распространения видов необходимо создание заповедников, заказников, памятников природы, а также запрещение сбора цветов и луковиц без лицензий, ограничение посещения мест произрастания редких растений туристами.

Существенную роль в сохранении богатств растительного мира играют ботанические сады, расположенные в различных климатических зонах. В них проводится изучение редких и эндемичных видов, разрабатываются вопросы охраны и рациональных способов размножения, вопросы реинтродукции и др.

Все растения нашей флоры должны быть сохранены для будущих поколений.